长白山是闻名世界的中药材基因宝库。这一得天独厚的资源优势，使吉林省享有“北药基地”的美誉。
2000年，国家批准吉林省建立中药现代化科技产业基地。我省的中药产业如虎添翼，迅猛发展起来。2004年，振兴东北老工业基地战鼓敲响，现代中药及生物制药基地，成为我省优先发展的5大基地之一。经过几年的建设，我省的中药产业已成为我省发展速度最快、效益最好、前景广阔的优势产业之一。2005年，创产值150亿元，5年时间产值增长近10倍，约占全国的1/10、全省医药工业总量的60%。近几年来，我省中药工业总产值、销售收入、利润等指标，在全国均名列前茅。
作为一个经济欠发达省份，我省中药产业之所以能在短短几年间崛起，得益于自主创新。
吉林省有丰富的中药材资源，全国重点普查的药材品种中，我省有40多个品种，蕴藏量占全国50%以上；全国常用药材品种中，我省占1/5。但是，多年来传统粗放的中药栽培方式，使这一资源优势没有发挥应有的作用。
在基地建设中，我省总结过去种植人参等品种正反两方面的经验，在管理模式上创新，摈弃“公司加农户”的分散经营模式，大力推广“以企业为主体直接经营”的中药材生产模式，废除订单，企业租用农民的土地，农民在基地中按企业的指导规范种植。广大农民在中药规范化种植方面，积累了丰富的经验，在他们原本不熟悉的GAP领域中，驾轻就熟地实施规范化种植。企业最终统一收购，质量认证由企业来把关，成为纳入规范化管理的“第一车间”。现在，省内著名制药企业，都有自己的种植（养殖）基地，如省内3大鹿乡，现已分别是修正、敖东、东丰药业的原料基地。近年来，我省有实力的中药企业，纷纷直接从事中药材生产开发，并上升为中药材GAP的主导力量，大幅度提高了中药材生产质量和规模。全省在建的GAP基地，有85%的承担主体是中药生产企业。
规范化种植带来明显的经济效益。现在，吉林五味子干品市场价，已由原来的8元/公斤，提高到40元/公斤；平贝母干品市场价，由原来40元/公斤，提高到现在的80元/公斤；人参出口价格由2001年的7010美元/吨，提高到现在的11664美元/吨，在国际市场逐渐恢复昔日的光彩。
自主创新是我省中药产业的主旋律。企业成为投资主体，高端产品拉动了我省中药产业迅速发展。我省拥有一批专门从事中医药研究开发的科研机构和科研人员，形成了一支以两院院士为学科带头人的专业中药现代化研究创新队伍。中药企业形成了以企业为投资主体的创新体系，从根本上改变了多年存在的科技成果转化难的现象，出现了产业等科研成果、等品种、等技术的局面。全省中药企业普遍加大了研发投入，每个大的医药企业，都有主管科技研发的副总，都有自己的研发中心。修正药业集团的研发投入，已占销售收入的10％。部分大型企业聘请了国内外一流专家做技术顾问，开发新药，还有的企业把研发中心建在北京、上海和长春等知识密集型城市，形成了产学研相结合的中药研发系统。省政府每年在医药科技方面的引导性投入已达千万，而企业在这方面的投入已达5亿元。
制药企业的技术开发能力不断增强。吉林敖东药业、修正药业、通化东宝等3户中药企业，被认定为国家级企业技术中心；通化万通等17户中药企业，被认定为省级企业技术中心。在286户企业中，有105户被认定为高新技术企业，约占37%。
吉林省把中医药基础理论、道地中药材规范化无公害种植（养殖）、中药新药开发、中药二次开发等制约基地发展的共性技术应用问题和产业发展的前瞻性重大发展方向问题，作为促进中药发展的科技创新重点，设立了“专项资金”，积极引导企业等社会资金的投放，组织不同单位和不同学科的各类人才开展联合攻关。据统计，全省中药企业年R＆D投入，达销售收入的3.5%。启动了“吉林人参振兴工程”、“道地中药材标准提取物研究”等一大批重大科技攻关专项，资助了150多个现代中药新药创新项目。截至目前，我省有69个原Ⅲ类以上中药新药新取得临床批号。2002至2005年，全省有44项现代中药项目获得省科技进步奖，其中二等奖以上17项。“梅花鹿、马鹿高效养殖增值技术”，获2004年度国家科技进步二等奖。
2000至2005年，全省获得自主知识产权的中药品种达150多个。吉林亚泰制药公司生产的“参一胶囊”，是我国第一个具有自主知识产权的抗肿瘤一类中药，是中药自主创新的经典之作。
为了使企业受益，方便产学研的合作，省科技主管部门加强了中药公共研发平台的建设。经过5年来的磨合，已构建起从中药材资源标准到新药开发、工业化中试、产品质量检测等比较系统的中药公共研发检测平台，为中药科技产业的发展提供了支撑条件。